佩戴彩色隐形眼镜所带来的副作用是很大的。戴隐形眼镜会使角膜处于异常低氧状态，从而影响角膜的发育。
青少年正处于生长发育的年龄，眼部组织特别是角膜发育还不成熟，为了角膜的健康，就必须保证角膜有充足的氧气供应，而彩色隐形眼镜是在普通隐形眼镜镜片上加镀颜色，它在超微结构下呈网状结构，镀上去的颜色会堵住镜片的部分透气孔，阻挡眼睛与空气中氧气和水分的交换，从而降低镜片的透氧透气性和透水性，很容易损伤角膜，严重者会导致角膜穿孔。有些孩子是过敏体质，受色素刺激会出现眼睛刺痛、流泪、结膜充血、角膜知觉减退等过敏表现，严重者甚至会导致视力下降或突发性失明。彩色隐形眼镜还会使角膜永久染色，最终严重影响到视觉功能。
